כ-37 שנים לאחר שנפל בשבי המצרי במלחמת יום הכיפורים, אורי אהרנפלד, צנחן שלחם במוצב "המזח" בתעלת סואץ, חוזר אל אותם חודשים איומים שבהם שהה בכלא עבאסייה הידוע לשמצה בקהיר.
לא רחוק מהצינוק שבו שהה, מבודד, מוכה, כואב ומושפל, כמו כל שבויי צה"ל, ישב שבוי נוסף. ערן יעקבי, שריונר, שנפל אף הוא בשבי באותו מצב. סיפורו של הצנחן, שמלווה בציוריו של השריונר, הם עדות לגיהינום השבי. כל שבי.
שבוי בפקודה הוא ספר מצמרר, שנקרא בנשימה אחת ומביא תמונה מזעזעת על "חוויית" השבי בידי האויב, ועל הדילמות המלוות כל חייל שעומד או יעמוד בעתיד בפני מצב דומה.