הספר "בשליחות המוסד לדרום סודן" הוא יומן מבצע המתעד את פעילותו של דוד בן עוזיאל, הידוע בכינויו “טרזן”, במסגרת שליחות מוסדית בדרום סודן בשנים 1969-1971. הספר מתאר בפירוט את המשימות החשאיות והאתגרים שעמדו בפניו בזמן תמיכתו במורדים הדרום-סודנים במהלך מלחמת האזרחים הראשונה בסודן, בניסיון לבסס קשר שתשרת את האינטרסים של ישראל באזור.
המחבר מציג בכתיבה אישית ועמוקה את הימים בהם פעל בשטח, את המציאות הקשה של האזור ועליית המתח בין הכוחות, וכן את האופן שבו הובילו פעולותיו להבנת המציאות הפוליטית והצבאית בדרום סודן. תיאוריו משקפים לא רק את האירועים, אלא גם את תחושת האחריות והמורכבות הניהולית והאנושית בהובלת מבצע כזה.
דרך היומן הקורא מקבל הצצה לעולם המוסד והמודיעין הישראלי באותה תקופה, להבנת הקשרים בין ישראל למורדים הדרום-סודנים, וכן לניסיון ליצור בריתות אסטרטגיות מרחיקות לכת. הפרקים כוללים גם תיאורים של מפגשים עם לוחמים מקומיים, נסיבות חיים קשות ואת הדילמות המוסריות שעמדו בפני המחבר והצוות שלו.
לבסוף, הספר לא מסתפק רק בסיפור המבצע, אלא נוגע גם בהשלכות של פעילות זו על ההיסטוריה של דרום סודן, ובמיוחד בהקשר של ההשפעה לאורך זמן על היחסים בין ישראל לאזור. הספר משלב בין סיפור אישי לבין ניתוח היסטורי של אירועים בעלי משמעות גדולה.